Les interruptions d'un ou de plusieurs médicaments ou de l'ensemble du traitement peuvent provoquer l'apparition de nouvelles résistances. De plus, en cas d’interruption de traitement, les médicaments à longue demi-vie, comme la bédaquiline ou la clofazimine, restent présents dans le sang pendant plusieurs mois. En pratique, c'est comme si le patient recevait bédaquiline et/ou clofazimine seule(s), ce qui amplifie le risque d’apparition de résistance à ces médicaments.
Les problèmes d’interruption de traitement par le patient (p. ex. arrêt de certains médicaments, interruptions récurrentes du traitement) doivent être détectés et résolus (prise en charge des effets indésirables si nécessaire et renforcement des mesures d’accompagnement du patient).
Un patient ayant interrompu l’ensemble du traitement depuis 2 mois ou plus répond à la définition d'un patient « perdu de vue » (Chapitre 17). Si le patient revient, réaliser de nouveaux tests bactériologiques (TMR, culture et pDST complet et/ou séquençage du génome) pour rechercher d’éventuelles nouvelles résistances. En fonction des résultats du TMR, débuter un nouveau schéma thérapeutique en attendant les résultats du DST complet, puis ajuster le traitement en conséquence.
Pour un patient ayant interrompu l’ensemble du traitement depuis 4 semaines ou plus mais depuis moins de 2 mois, réaliser de nouveaux tests bactériologiques comme ci-dessus. En fonction de l'état clinique du patient et des résultats du TMR, débuter un nouveau schéma thérapeutique ou reprendre le traitement au point où il a été interrompu en attendant les résultats du DST complet, puis ajuster le traitement en conséquence. Si le traitement interrompu est repris, rattraper les doses manquées pendant l'interruption pour terminer le traitement.